校学生会应注重校、院、系学生会“三级一体”的管理。坚持领导明确、合作互利的原则，通过活动合作的方式，使校、院、系二级学生会的联系更为紧密。校学生会的大型活动，可以由院或系学生会招标承办和协办，对资源进行优化组合，一节省人力物力，避免“撞车”现象。
在干部机制的建设上，校学生会要充分重视对学生会干部的选拔，建立起“班一系一院一校”的于部选拔机制，增强校学生会对院、系学生会的凝采力和吸引力，同时，校学生会应重视校、院、系三级学生会干部的交流，可以组织“校、院、系长级学生会干部交流挂职锻炼”。
通过例会制度形成校、院、系三级学生会的统一管理，通过多方讨论、全体表决等多种形式来监督校、院、系二级学生会的各项工作，客观上加强各级学生会工作的透明度。加强相互之间的了解与交流。彻底消除各级学生会间的相互抵触、“抬杠”等现象，开创校学生会工作的新局面。
